鉄道会社は輸送障害の内容や原因を地方運輸局に報告する義務がある。国土交通省によると、０５年度の報告件数は前年度より３９６件（８％）増で、９０年代前半のほぼ２倍の水準になった。

　中でも、自殺や災害によらない、鉄道会社の設備・車両の故障や人的ミスによる「部内原因」の障害が目立つ。０５年度は前年比で２７％増。今年９月２８日に起きたＪＲ東京駅地下の変電所火災では、ＪＲ京葉線が８時間以上止まる事態となった。

　国交省鉄道局は「なぜダイヤの乱れが増えたのか、理由はわからない」とする。だが、関西のある鉄道会社の担当者は、０５年度の増加については「０５年４月のＪＲ宝塚線（福知山線）脱線事故以来、何かトラブルが起きた場合の運転再開に慎重になり、結果的に遅れが増えたのでは」とみる。

　ＪＲグループ７社の輸送障害発生率は私鉄よりもはるかに高い。走行１００万キロあたりの発生件数は、ＪＲ（在来線）が６．０件に対し、私鉄・地下鉄は２．１件だ。

　ＪＲ各社は「私鉄に比べて電車の運転系統が複雑で、運転本数も増やしてきた影響が大きい」と説明する。例えばＪＲ西日本は民営化後、京阪神を結ぶ京都・神戸線と、宝塚、学研都市線や関西空港線を直通する電車を増やしてきた。乗客には便利だが、余裕が乏しくモザイクのようなダイヤが生まれ、いったんどこかでトラブルが起きると影響が広範囲に及ぶことになる。

　また、各鉄道会社が人口減少に備えて進める要員削減などの効率化が、輸送障害を深刻化させているとの見方もある。昨年７月と今年２月に関東で起きた地震では、線路を点検するＪＲ東日本の作業員の手配が追いつかず、復旧が遅れた。大雪が続いた昨冬は、除雪に手が回らず、運休が長引いた例も多かった。

　鉄道各社は「輸送障害を減らす努力は常にしてきた」と強調する。宝塚線事故を起こしたＪＲ西日本は安全関係の投資を大幅に増額し、故障に備えた予備車両の配置や老朽設備の更新を進める。今年３月には所要時間を延ばすダイヤ改定をし、遅れが出にくくした。

　線路の陥没や信号故障などが続くＪＲ東日本は７月、復旧要員の増員など総額７０億円の緊急対策を決めた。

　輸送障害の発生率が主要各社で最も高いＪＲ北海道は雪による故障が主因とみて、車両構造の強化に取り組む。

　大手私鉄で最も発生率が高かった阪神電鉄は、故障が多かった車両機器の一斉点検を実施した。

　鉄道関係者は「ダイヤ通り走る時が最も安全。乱れた時は焦りや勘違いから、さらに大きなミスを犯しやすい」と言う。鳥取県のＪＲ伯備線で今年１月、踏切トラブルなどでダイヤが乱れ、単線の作業現場を通る特急の順序が変更になったのを現場責任者が勘違いした。その結果、保線作業員３人が特急にはねられて死亡する大惨事につながった。